Kuroko kümmert sich um das kleine Mädchen Rinko, die heute ihren ersten Schultag an der Privatschule Marimo hat, auf die auch Hinako geht. Kaum hat sie sich an das Schulleben gewöhnt, gibt es im Gebäude der Oberstufe eine Explosion… Als sie von der Schulleitung verständigt wird, ist Kuroko sofort zur Stelle. Ihre Nachricht an die Schülerinnen ist keine gute: Die Explosion war kein Unfall, und der vermeintliche Täter hat eine Drohung ausgesprochen. Daraufhin stellt sich eine Schülerin aus der dritten Oberstufe freiwillig. Kuroko, ihrerseits ein Genie im Bombenbau, braucht nicht lange, um herauszufinden, dass sich Minako Suo mit der Bombe an ihren Peinigern rächen will, die sie seit jeher drangsaliert haben. Doch gerade als Kuroko glaubt, den Fall gelöst zu haben, detoniert eine weitere Bombe…